Química Informática: Diseño y Análisis Molecular

1. Diseño de Moléculas utilizando Avogadro

Avogadro es una herramienta poderosa para el diseño y visualización molecular. En esta sección aprenderemos los fundamentos del diseño molecular.

1.1 Interfaz básica de Avogadro

Interfaz de Avogadro

1.2 Creación de moléculas básicas

Pasos para crear una molécula:

  1. Seleccionar herramienta "Draw"
  2. Elegir tipo de átomo
  3. Colocar átomos en el espacio 3D
  4. Crear enlaces entre átomos

2. Optimización de Geometrías Moleculares con MM

Optimización de geometría

2.1 Fundamentos de la Mecánica Molecular

2.2 Proceso de Optimización

  1. Seleccionar campo de fuerza apropiado
  2. Configurar parámetros de optimización
  3. Ejecutar minimización de energía
  4. Analizar resultados
Nota importante: La elección del campo de fuerza es crucial para obtener resultados precisos.

3. Cálculo de Propiedades con Avogadro

3.1 Propiedades Disponibles

Análisis de propiedades

4. Diseño de Estructuras Moleculares con WebMO

Interfaz WebMO

4.1 Interfaz de WebMO

Importante: Asegúrese de guardar su trabajo regularmente en WebMO.

5. Cálculo de Orbitales Moleculares con WebMO

Orbitales moleculares

5.1 Configuración de Cálculos

  1. Selección del método de cálculo
  2. Elección del conjunto base
  3. Configuración de parámetros
  4. Ejecución del cálculo
Consejo: Comenzar con métodos más simples antes de pasar a cálculos más complejos.

6. Determinación de HOMO y LUMO

HOMO-LUMO

6.1 Análisis de Orbitales Frontera

6.2 Aplicaciones

Recursos Adicionales